Institut Peradaban melakukan kerjasama secara nasional dan internasional dengan berbagai pihak yang kompeten dan memiliki komitmen untuk membangun Indonesia lebih baik. Beberapa programnya di antaranya adalah sebagai berikut: 

PENELITIAN

Institut Peradaban melakukan berbagai kegiatan untuk mendapatkan white paper policy bagi perubahan untuk Indonesia. Penelitian ini dilakukan baik secara internal, atau bekerjasama dengan lembaga lain. Penelitian dapat dilakukan dalam bentuk penelitian langsung (lapangan) atau kepustakaan.

Beberapa tema penelitian yang dikembangkan antara lain: penegakan supremasi hukum, keadilan, demokratisasi, ekonomi, agama, kesehatan, pemberdayaan masyarakat dan pendidikan.

Terkait dengan penelitian juga, Institut Peradaban mengadakan seminar, lokakarya, workshop, diskusi dan pelatihan. Hal ini berguna untuk memberikan perspektif baru dan diharapkan bersifat aplikatif, bekerjasama dengan lembaga dalam atau luar negeri dengan mengundang para pakar di bidangnya masing-masing. Kegiatan penelitian serta pertemuan ilmiah itu dapat dilakukan dengan skala nasional atau internasional. 

PUBLIKASI DAN PENERBITAN

Institut Peradaban menerbitkan jurnal yang memuat hasil Kajian dan Riset dengan nama “Jurnal Peradaban” yang ditujukan untuk pemerintah, akademisi dan masyarakat luas. Jurnal ini diharapkan dapat menjadi refensi dalam kajian-kajian keindonesiaan, dan sebagai wadah bertukar pikiran antar pembacanya. Jurnal berisi tentang Indonesia dilihat dari berbagai aspek, disertai dengan solusi bagi pembangunan kembali Indonesia.

Selain itu, Institut Peradaban juga menerbitkan buku-buku yang terkait dengan Indonesia baik dalam bahasa Indonesia maupun bahasa asing. Buku ini diharapkan menjadi rujukan dengan data-data yang terkini dan aplikatif bagi pembangunan.

Termasuk dalam hal ini adalah pengelolaan virtual office (terlampir), dan jejaring sosial di dunia maya. Hal ini berguna untuk sosialisasi kegiatan-kegiatan Institut Peradaban, baik berita (news), atau citizen journalism, atau analisis dan pandangan terhadap berbagai masalah yang terkait dengan peradaban. 

KONSULTASI DAN ADVOKASI

Institut Peradaban juga menyediakan layanan konsultasi dan advokasi. Tema konsultasi beragam bentuknya terkait dengan masalah ekonomi, politik, hukum, agama, serta sosial dan budaya. Konsultasi akan ditangani oleh para pakar yang telah dikenal, dan bersifat aplikatif.

Pelayanan advokasi juga memberikan kesadaran kepada klien untuk mengetahui hak-haknya. Pelayanan ini ditangani langsung oleh para pakar yang telah mumpuni di bidang advokasi.